ProRoot MTA beinhaltet Kalziumoxid, welches in Kontakt mit Gewebsflüssigkeit zu Kalziumhydroxid umgewandelt wird. Das Kalziumhydroxid zerfällt in Kalzium- und Hydroxylionen, was zu einem Anstieg des pH-Werts und einer Kalziumionenfreisetzung führt. ProRoot MTA kann daher als Alternative zu Kalziumhydroxidpräparaten verwendet werden. Laut Herstellerdeklaration umfasst die Anwendung von ProRoot MTA als "endodontischer Reparatur- Zement" folglich auch die Überkappung der Pulpa. Der Vorteil von ProRoot MTA als Material für die direkte Überkappung liegt in seiner im Vergleich zu Kalziumhydroxid höheren mechanischen Festigkeit, der geringeren Löslichkeit und dem dichteren Verschluss.